Translating BLAST可以讓你將一個基因排列轉換至 蛋白質排列，反之亦然，再將結果和NCBI的資料庫作比較。我們將會介紹其中一種Translating BLAST：Translated query - Protein db [blastx]。Translated query - Protein db [blastx]可以將一個基因排列轉換至 蛋白質排列(包括六種不同閱讀方法)，而轉換出來的蛋白質排列將會和NCBI的蛋白質資料庫作比較。

首先進入BLAST，找尋Translating BLAST，再進入Translated query - Protein db [blastx]。

你可在search的位置上貼上基因排列，在choose a translation中，選blastx，在choose database的地方可選擇要找尋的資料庫，例如：老鼠、果蠅等(通常用non-redundant來找人類的資料就可以了)，再按blast!，之後按Format!來開始找尋。

此時一個會自動更新的新視窗會被開啟，耐心等一會直至工作完畢，結果便會列出來。

當結果列出後，查看準確度分佈圖，再按最高準確度的棒，那這一個蛋白質將最有可能是你輸入的 DNA排列傳譯出來的蛋白質。在並列的部份，你可看看你輸入的排列傳譯出來的蛋白質排列(A.)和資料庫中的資料(B.)有多相似，你亦可按超連結以獲得這蛋白質的資料。