DNA 結合蛋白 - GAL4 轉錄因子

• 開啟 "gal4.pdb"

只把蛋白質顯示成 "Cartoons" 模式

RasMol> select protein

RasMol> wireframe off

現在你只看見 DNA 分子

RasMol> cartoons on

• 你可以使用 "not", "and", "or" 來作一些複雜的選擇

RasMol> select dna and backbone

RasMol> color green

RasMol> select not selected

RasMol> color bluetint

RasMol> select protein

RasMol> color cyan

RasMol> select dna

RasMol> spacefill on

• 只選擇腺嘌呤(adenine)和鳥糞鹹(guanine)

RasMol> select (A or G) and not backbone

RasMol> color magenta

• 只選擇距離 DNA 5.0 埃 (Angstroms) 的蛋白質原子

RasMol> select within ( 5.0,dna) and protein

RasMol> color blue